clang compile fixes

release: fix for rm -rf

. new rm can return failure exit code

ELF hardlinks in /boot for compatibility with old boot.

VFS: replace VFS with AVFS

libmthread: fix typo in comments

libmthread: add guard pages to stacks

Add guard pages to the top of the stack to catch overflow errors.
Moreover, fix a bug where libmthread would keep using a stack that was
just deallocated; a detached thread would deallocate its own stack after
it was finished running).

libmthread: don't free() user allocated stack space

libblockdriver: increase stack size to 8KB per thread

silence makewhatis in daily script

sys: move some include dirs

. sys/machine should be sys/arch/i386

.gitignore: add another generated directory

AVFS: reinitialize lookup object before reuse

Also clean share/*, including zoneinfo

Fix shutdown message in setup.sh

Proper banner for CD.

Warn users about non NetBSD mbr.

New boot doesn't work with old mbr, when there are multiple MINIX
partitions. Warn user about it and suggest to install new mbr.

Support reinstall and new boot.

Build both old boot and new boot (for setup).

Build release CD based on new boot.

Also add stuff for usb stick and hdemu.

writeisofs: also boots plain binaries with -B

With -n -b file, a.out boot images can be used for CD booting;
with the new -n -B file option, plain binary (like bootxx_cd9660)
can be used instead.
Restore working the -h and -f options while there.
And add a new -F option for 2.8MB floppy image.

writeisofs: improve compatibility

Register file timestamps
Remember the path tables in the primary descriptor
Put the size of the parent directory in the \1 entry, not own size
Allow the use of -b option without -a

Notes:
* Still missing the man page
* Filenames are still trimmed to 12 characters, because of
  8.3 MS-DOS inherited compatibility (ISO9660 level 1);
  also note that 7.4 or 9.2 filenames are accepted though
* Final . at end of filenames without extension is still missing
* VMS-compatible ;1 version suffix is still omitted
* Limit of 65,535 directories in path tables is not checked

Add new boot to the setup.

Build ELF for release (chrootmake).

Switch part/autopart to new mbr bootblock

Fixes for loading kernel with multiboot

While parsing command line, only consider "variable=value" to
be part of environment.

Patch by Antoine Leca.

Allow human readable name for the root device.

Instead of using rootdev= or ramimagedev= in the boot monitor
which are changed to numbers and cannot be used with other
loaders, rootdevname= or ramimagename= are (MINIX-style)
device names always stored as strings.

Patch by Antoine Leca.

Rotate kernels/images/modules.

Kernels and system services are stored in a single directory in the
/boot/minix/ and rotated like /boot/images. /boot/minix_latest slink
is created automatically.
System serives are prefixed by "modNN_" to allow to easily load them
using "mod*" pattern.

Integrate new boot stuff into build scheme.

- Build sys with everything else.
- Gitignore files built by new boot stuff.

Remove libkern, leave just header.

Boot stuff dependencies from NetBSD.

Patch by Antoine Leca. Relocated to src/sys.

The port is using the same libminc.a as usual MINIX services (and does
not use NetBSD libkern); the headers imported from NetBSD sys/ tree
have been kept to a minimum (still numbers higher than 30 though.)

Note the peculiar way to use libraries (libsa, libi386, etc.): the
source code is shared, but each component builds its own copy of the
library, with its own set of preprocessor defines.

Port cdboot.

Import cdboot.

Port MBR.

Patch by Antoine LECA.

Import sys/arch/i386/stand/mbr.

Port installboot as installboot_nbsd and rename the old one.

Also following functionality was added:
- Add install_master to the installboot from NetBSD.
- Check if enough space for bootxx.

Old installboot was renamed to installboot_minix.

Import usr.sbin/installboot.

Port bootxx.

Adjust boot from NetBSD.

- Add load_mods command to boot2 (load_mods /dir/mod*).
- Rename resulting binary to boot_monitor.
- Change default banner when used in MINIX.

Fix bug in libsa/ls.

Initial import of libsa, libkern, bootxx, boot.

AVFS/APFS: small cleanup

AVFS: fix various system call interruption issues

 - When cancelling ioctls, VFS did not remember which file descriptor
   to cancel and sent bogus to the driver.
 - Select state was not cleaned up when select()ing process was
   interrupted.
 - Process trying to do a system call at the exact same time as a user
   trying to interrupt the process, could cause the system call worker
   thread to overwrite state belonging to the worker thread trying to
   exit the process. This led to hanging threads and eventual system hang
   when this happens often enough.

libchardriver: fix open reply for async devices

-lminixutil link fixes

. not available and not needed for clang

Enlarge ramdisk size (blocks).

NBSD INCLUDES - fixed missing vm_remap_ro() proto

inet: strncmp() fix

temporarily disable update-superblock check

. incompatible with installboot -d FSDEV on mounted filesystems
. should be re-enabled when netbsd boot loader is default

APFS: fix link issue when compiling with Clang

INET: fix 'improved' assert

Remove unused variables

INET: fix a few GCC compilation warnings

libpuffs: make GCC happy

AVFS: only put mount point when it was used as one

When a mount operation fails and the FS exits, free_proc could try and
clean up resources associated with the mount point before the mount
thread itself can do that. However, the clean up procedure should only
clean up resources that were actually in use.

service: allow starting service with user's realuid

e1000: reset hardware before stopping

INET: remove erroneous assert

The queue may contain established connections which have
tc_connInprogress clear.

Don't panic on a misconfigured machine

Add permission test for bind and socket

Also, apply forbidden patch to VFS from AVFS (fixes hanging test56 if
it has the permission test).

INET: drop privileges upon startup

APFS: drop privileges upon startup

Move SERVICE_LOGIN to rs.h global header so it's accessible for all.

AVFS: make forbidden check for specific proc instead of fp

AVFS: initialize root FS before receiving new work

PM: extend srv_fork to set a specific UID

Currently, all servers and drivers run as root as they are forks of
RS. srv_fork now tells PM with which credentials to run the resulting
fork. Subsequently, PM lets VFS now as well.

This patch also fixes the following bugs:
 - RS doesn't initialize the setugid variable during exec, causing the
   servers and drivers to run setuid rendering the srv_fork extension
   useless.
 - PM erroneously tells VFS to run processes setuid. This doesn't
   actually lead to setuid processes as VFS sets {r,e}uid and {r,e}gid
   properly before checking PM's approval.

Prevent the ramdisk makefile from failing if the last image is not ELF

SMP - clock calibration spurious IRQ deadlock fix

 - this patch fixes a deadlock which may occur if we get a
   spurious interrupt while calibrating clocks during the boot
   time. Since we never handle interrupts while in the kernel
   (BKL locked) the interrupt code locks the lock. This is a
   different situation, a corner case, boot time only. We do not
   return to userspace but to the kernel, so the BKL is not
   unlocked. So we need irq handler which leaves the BKL
   unlocked.  The clock handler does it already, this patch adds
   a dummy spurious irq handler for the same reason. It is better
   to handle the situation this way to keep the normal runtime
   code simple.

SMP - no_apic=0 and acpi=1 set when CONFIG_SMP=y

- this is a temporary change which makes images compiled for SMP
  boot in SMP mode by default.

- this change is needed until we can configure the multiboot
  images from the boot loader again.

Revert 93b9873a562b11dfedf5f4e53ef87bf256d80207

- non need to have free PDEs per CPU since we only run one
  instance of the kernel at any time

mtree: zoneinfo dirs

Don't overwrite old mv, ln, cp, etc man pages with new rm

Don't print events that happen often

lseek should not yield a negative file position

Don't try to find file position beyond double indirect blocks

Add support for survival of crashed FSs

When an FS crashes, VFS will clean up resources tied to that FS:
 - Pending requests to the FS are canceled (i.e., fail with EIO)
 - Threads waiting for a reply are stopped (i.e., fail with EIO)
 - Open files are marked invalid. Future operations on a file descriptor
   will cause EBADF errors.
 - vmnt entry is cleared, so in-flight system calls that got past the
   file descriptor check but not yet talking to the crashed FS, will
   fail with EIO.
 - The reference counter of the mount point is decreased, effectively
   removing the crashed FS from the file system tree. Descendants of
   this part of the tree are unreachable by means of a path, but can
   still be unmounted by feeding the block special file to unmount(2).

This patch also gets rid of the "not a known driver endpoint" messages
during shutdown.

mfs: mark blocks clean when invalidated

. it could happen that newly filled blocks were still marked
  dirty
. causing unnecessary i/o and the new warning of the superblock
  being written

Use correct value for _NSIG

User processes can send signals with number up to _NSIG. There are a few
signal numbers above that used by the kernel, but should explicitly not
be included in the range or range checks in PM will fail.

The system processes use a different version of sigaddset, sigdelset,
sigemptyset, sigfillset, and sigismember which does not include a range
check on signal numbers (as opposed to the normal functions used by normal
processes).

This patch unbreaks test37 when the boot image is compiled with GCC/Clang.

INET: initialize timer to not-in-use

New zoneinfo port from NetBSD

Replace rm and rmdir with NetBSD version

Remove unused variable

Increase thread stack space for GCC compiled images

AVFS: Return actual last dir when path is named by a symlink

Last_dir didn't consider paths that end in a symlink and hence didn't
actually return the last_dir when provided with one. For example,
/var/log is a symlink to /usr/log. Issuing `>/var/log' would trigger
an assert in AVFS, because /var/ is not the actual last directory; /usr/
is.

Last_dir now verifies the final component is not a symlink. If it is, it
follows the symlink and restarts finding of the last the directory.

vfs/avfs: renumber stat calls so as to be unique

The old stat call numbers are still supported for a while.

Cut PM out of the adddma/deldma/getdma call path

Remove obsolete PROCSTAT/getsigset call.

Implement AcpiOsStall, AcpiOsSleep, AcpiOsGetTimer

- change AcpiOsRemoveInterruptHandler() to print a warning
  instead of panic.

- we do the same in AcpiOsInstallInterruptHandler().

Signed-off-by: Tomas Hruby <thruby@few.vu.nl>

vm_remap_ro

- allows shared memory to be mapped in readonly

- ben@minix3.org & tom@minix3.org

VM - vm_unmap() takes SELF as valid argument

VM - clear vminhibit iff it was set

SMP - asyn send SMP safe

- we must not deliver messages from/to unstable address spaces.
  In such a case, we must postpone the delivery. To make sute
  that a process which is expecting an asynchronous message does
  not starve, we must remember that we skipped delivery of some
  messages and we must try to deliver again once the source
  address space is stable again.

SMP - smp_schedule()

- always issues an IPI

SMP - cpu_is_idle made volatile

SMP - fixed usage of stale TLB entries

- when kernel copies from userspace, it must be sure that the TLB
  entries are not stale and thus the referenced memory is correct

- everytime we change a process' address space we set p_stale_tlb
  bits for all CPUs.

- Whenever a cpu finds its bit set when it wants to access the
  process' memory, it refreshes the TLB

- it is more conservative than it needs to be but it has low
  overhead than checking precisely

SMP - fixed IPI livelock

- two CPUs can issue IPI to each other now without any hazzard

- we must be able to handle synchronous scheduling IPIs from
  other CPUs when we are waiting for attention from another one.
  Otherwise we might livelock.

- necessary barriers to prevent reordering

SMP - do_update fix

- adjust_proc_slot() must preserve scheduling info, for example
  on which cpu the process should run

- do_update() - consitency check

KERNEL - cause SIGSEGV if bad pointer to kernel

KERNEL - mini_senda simplification

KERNEL - has_pending() not exposed

- has_pending() takes a special argument that tells the code
  whether we are scanning for asynchronous message or something
  else.

- has_pending() is not used directly anymore

- the new functions are wrappings around has_pending() to make
  the use more comfortable.

- these functions should become static inline eventually

KERNEL - do_privctl() fix

- after a driver is restarted, do not register permissions
  which are already set again.

Increase ramdisk size for clang

Allow clang for kernel compilation

Remove .ident sections, and force separations of .text and
.data sections into separate program headers, for the benefit
of the check done by MINIX boot monitor in multiboot mode.