Fix ptrace bug when reattaching to a detached process

Complete ovehaul of mode switching code

- after a trap to kernel, the code automatically switches to kernel
  stack, in the future local to the CPU

- k_reenter variable replaced by a test whether the CS is kernel cs or
  not. The information is passed further if needed. Removes a global
  variable which would need to be cpu local

- no need for global variables describing the exception or trap
  context. This information is kept on stack and a pointer to this
  structure is passed to the C code as a single structure

- removed loadedcr3 variable and its use replaced by reading the %cr3
  register

- no need to redisable interrupts in restart() as they are already
  disabled.

- unified handling of traps that push and don't push errorcode

- removed save() function as the process context is not saved directly
  to process table but saved as required by the trap code. Essentially
  it means that save() code is inlined everywhere not only in the
  exception handling routine

- returning from syscall is more arch independent - it sets the retger
  in C

- top of the x86 stack contains the current CPU id and pointer to the
  currently scheduled process (the one right interrupted) so the mode
  switch code can find where to save the context without need to use
  proc_ptr which will be cpu local in the future and therefore
  difficult to access in assembler and expensive to access in general

- some more clean up of level0 code. No need to read-back the argument
  passed in
  %eax from the proc structure. The mode switch code does not clobber
  %the general registers and hence we can just call what is in %eax

- many assebly macros in sconst.h as they will be reused by the apic
  assembly

Clock task split

- preemption handled in the clock timer interrupt handler, not in the clock task

- more achitecture independent clock timer handling code

- smp ready as each CPU can have its own timer

Fix for broken parsing of memory environment string in pci driver

- unfixed parsing could run away from the the string and fail on a correct
  string in complete_bars()

- it reanables the body of complete_bars()

inodes - using types with known size

- fixes a problem in inodes truct definitions. The original definitions use
  posix types. These types don't have well defined size. Therefore when
  compiling mkfs on a different system natively the inodes sizes do not match.
  This patch replaces the posix types with interger types of the same size and
  signedness as the original types in use.

Changes to the include files in order to make cross-compilation possible.

- The primary reason is that mkfs and installboot need to run natively during
  the cross compilation (host and target versions are compiled). There is a
  collision of include files though. E.g. a.out.h is very minix-specific.
  Therefore some files we moved and replaced by stubs that include the original
  file if compiling on or for Minix :

  include/a.out.h -> include/minix/a.out.h
  include/sys/dir.h -> include/minix/dir.h
  include/dirent.h -> include/minix/dirent.h
  include/sys/types.h -> include/minix/types.h

- This does not break any native compilation on Minix. Other headers that were
  including the original files are changed according to include directly the
  new, minix specific location not to pick up the host system includes while
  cross-compiling.

- role of this patch is to make rebasing of the build branch simpler until the
  new build system is merged

vmassert reports also the source file in which it was triggered

Hardware interrupts code path cleanup

- the PIC master and slave irq handlers don't pass the irq hook pointer but just
  the irq number. It gives a little bit more information to the C handler as the
  irq number is not lost

- the irq code path is more achitecture independent. i386 hw interrupts are
  called irq and whereever the code is arch independent enough hw_intr_
  functions are called to mask/unmask interrupts

- the legacy PIC is not the only possible interrupt controller in the x86 world,
  therefore the intr_(un)mask functions were renamed to signal their
  functionality explicitly. APIC will add their own.

- masking and unmasking PIC interrupt lines is removed from assembler and all
  the functionality is rewriten in C and moved to i8259.c

- interrupt handlers have to unmask the interrupt line if all irq handlers are
  done. Assembler does not do it anymore

  - enable remembering of device memory ranges set by PCI and
    told to kernel
  - makes VM ask the kernel if a certain process is allowed
    to map in a range of physical memory (VM rounds it to page
    boundaries afterwards - but it's impossible to map anything
    smaller otherwise so I assume this is safe, i.e. there won't
    be anything else in that page; certainly no regular memory)
  - VM permission check cleanup (no more hardcoded calls, less
    hardcoded logic, more readable main loop), a loose end left
    by GQ
  - remove do_copy warning, as the ipc server triggers this but
    it's no more harmful than the special cases already excluded
    explicitly (VFS, PM, etc).

Various small IS, TTY, isofs fixes

IS:
- do not use p_getfrom_e for a process that is sending
- register with TTY only function keys that are used
- various header and formatting fixes
- proper shutdown code

TTY:
- restore proper Ctrl+F1 dump contents

isofs:
- don't even try to call sys_exit()

Kernel: add support for indirect grants

ash: only execute regular files

Kernel, servers: remove unused proto.h definitions

PM: clean up endpoint info API/ABI

Conversion of kernel assembly from ACK to GNU

- .s files removed and replaced by .S as the .S is a standard extension for assembly that needs preprocessing

gas2ack

    - an asmconv based tool for conversion from GNU ia32 assembly to ACK assembly

    - in contrast to asmconv it is a one way tool only

    - as the GNU assembly in Minix does not prefix global C symbols with _ gas2ack
      detects such symbols and prefixes them to be compliant with the ACK convention

    - gas2ack preserves comments and unexpanded macros

    - bunch of fixes to the asmconv GNU->ACK direction

    - support of more instructions that ACK does not know but are in use in Minix

    - it is meant as a temporary solution as long as ACK will be a supported
      compiler for the core system

PM, VFS: remove unused param.h definitions

PM: remove unused core_name variable

DS: do not panic when sending reply fails

Create man pages for bigsh and dev2name

Ground work for larger file systems, and miscellaneous fixes:
- MFS and mkfs(1) now perform extra sanity checks
- fsck(1) can now deal with inode tables extending beyond the file
  system's first 4GB
- badblocks(8) no longer writes out the superblock for no reason
- mkfs(1) no longer crashes when given no parameters
- more(1) no longer crashes when standard output is redirected

Don't check DMA_ST_ERROR before DMA_ST_INT is set (which is done too)

Increase limits on PCI devices to have space for the new RTL8139 ACLSs

if from branch, include branch name in in-image tag and .iso filename.

throw out unnecessary drive1 thing

newer at_wini.c (really incl atapi dma this time)

include OSS on CD

 - reverse order of transfer command and DMA initiation - fixes DMA problem
   that some hardware had
 - clear DMA_ST_INT after DMA - fixes infinite number of interrupts
   that some hardware had
 - initial ATAPI DMA implementation, doesn't actually increase performance
   on my test hardware so possibly not right yet, disabled by default

no DEBUG_VMASSERT committed

Suppress spurious scancodes in VMWare

Add more identifiers to drivers.conf for orinoco and rtl8137.
Increase RSS_NR_PCI_ID and remove dumplicate reference
to /etc/drivers.conf; each such reference uses _PATH_DRIVERS_CONF
from <minix/paths.h> now.

moving OSS to a package.

support for head -n (suggested by xorquewasp)

Network card autodetection in netconf.sh

Add lspci command and SI_PCI_INFO getsysinfo call

inet: fix TCP connection corruption bug (causing test40 to fail sometimes)

Report make issue in UPDATING (approved by Ben)

Add nohup tool (approved by Ben)

fix compiler warning by including for prototype.

add prototype for wait_for() to fix compiler warning.

fix compiler warnings using dubious casts.

fix compiler warning

fix compiler warning due to const char * -> char *

really revert endpoint_t -> int

debugging info on panic: decode segment selectors and descriptors, now moved
to arch-specific part, prototypes added; sanity checking in debug.h made
optional with vmassert().

thanks to tomas: fix for level0() race condition - global variable can
be used concurrently.  pass the function in eax instead; this gets rid
of the global variable.  also execute the function directly if we're
already trapped into the kernel.

revert of u32_t endpoint_t to int (some code assumes endpoints are
negative for negative slot numbers).

little more info in pagefault exception handler.

 - exact magic values for entered/nonentered states in recursive enter check
 - read_*() functions to read segment selector values
 - decode loaded segments on panic

 - panic if there's no runnable process
 - more basic sanity check before recursive enter check (data segment)
 - try to jump to boot monitor instantly on recursive panic

packman -y: noninteractive mode to install all packages

fixed grep usage in filter (again)

don't have ackpack in the list any more as it installs an
old /usr/bin/make.

Unique matching for package name when grepping for it in the master list.

Add id(1) -g, -n, -r options (Bug#302, reported by Aleksey Cheusov)

isofs links with libsysutil which does not exist anymore

dirs for OSS

revert to 16MB to fix reinstall for now.

INET: fix panic when network drivers are started late (Bug#309, reported by Niek Linnenbank)

RS: disable harmless warning

postgresql in packing list

slightly larger /usr needed

connect OSS to the build (clean and install only)

Fix bios_wini using wrong size for vector (Bug#280, reported by John Peace)

Remove treecmp utility (Bug#310, reported by John Peace)

Fix writeisofs lseek() usage (Bug#311, reported by John Peace

dir for oss config files

Fix syslog buffer overflow (Bug#270, reported by Kevin Jordan)

support for OSS.

Fixes to ISOFS

Initial import of ISOFS by Jacopo Urbani

implement VAR += .. feature, contributed by Pieter Hijma

PM delay call infrastructure improvements
- allow PM to tell sys_runctl() whether to use delay call feature
- only use this feature in PM for delivering signals - not for exits
- do better error checking in PM on sys_runctl() calls
- rename SIGKREADY to SIGNDELAY

Make message type ranges in com.h (eventually) unique

Fix erroneous times() call in udpstat/tcpstat.
Reported by John Peace, bug #312.
Also fix times(2) man page.

idle_task() declared 3x in kernel/proto.h. 2 declarations removed

Increase root partition size to 64 MB.

 - retrieve binary packages and sources from webserver to make a release, incrementally using wget
   (so wget required)
 - don't build List file again, but use webserver List file and filter it

Bump release to 3.1.5 in issue.install

Merge of David's ptrace branch. Summary:
o Support for ptrace T_ATTACH/T_DETACH and T_SYSCALL
o PM signal handling logic should now work properly, even with debuggers
  being present
o Asynchronous PM/VFS protocol, full IPC support for senda(), and
  AMF_NOREPLY senda() flag

DETAILS

Process stop and delay call handling of PM:
o Added sys_runctl() kernel call with sys_stop() and sys_resume()
  aliases, for PM to stop and resume a process
o Added exception for sending/syscall-traced processes to sys_runctl(),
  and matching SIGKREADY pseudo-signal to PM
o Fixed PM signal logic to deal with requests from a process after
  stopping it (so-called "delay calls"), using the SIGKREADY facility
o Fixed various PM panics due to race conditions with delay calls versus
  VFS calls
o Removed special PRIO_STOP priority value
o Added SYS_LOCK RTS kernel flag, to stop an individual process from
  running while modifying its process structure

Signal and debugger handling in PM:
o Fixed debugger signals being dropped if a second signal arrives when
  the debugger has not retrieved the first one
o Fixed debugger signals being sent to the debugger more than once
o Fixed debugger signals unpausing process in VFS; removed PM_UNPAUSE_TR
  protocol message
o Detached debugger signals from general signal logic and from being
  blocked on VFS calls, meaning that even VFS can now be traced
o Fixed debugger being unable to receive more than one pending signal in
  one process stop
o Fixed signal delivery being delayed needlessly when multiple signals
  are pending
o Fixed wait test for tracer, which was returning for children that were
  not waited for
o Removed second parallel pending call from PM to VFS for any process
o Fixed process becoming runnable between exec() and debugger trap
o Added support for notifying the debugger before the parent when a
  debugged child exits
o Fixed debugger death causing child to remain stopped forever
o Fixed consistently incorrect use of _NSIG

Extensions to ptrace():
o Added T_ATTACH and T_DETACH ptrace request, to attach and detach a
  debugger to and from a process
o Added T_SYSCALL ptrace request, to trace system calls
o Added T_SETOPT ptrace request, to set trace options
o Added TO_TRACEFORK trace option, to attach automatically to children
  of a traced process
o Added TO_ALTEXEC trace option, to send SIGSTOP instead of SIGTRAP upon
  a successful exec() of the tracee
o Extended T_GETUSER ptrace support to allow retrieving a process's priv
  structure
o Removed T_STOP ptrace request again, as it does not help implementing
  debuggers properly
o Added MINIX3-specific ptrace test (test42)
o Added proper manual page for ptrace(2)

Asynchronous PM/VFS interface:
o Fixed asynchronous messages not being checked when receive() is called
  with an endpoint other than ANY
o Added AMF_NOREPLY senda() flag, preventing such messages from
  satisfying the receive part of a sendrec()
o Added asynsend3() that takes optional flags; asynsend() is now a
  #define passing in 0 as third parameter
o Made PM/VFS protocol asynchronous; reintroduced tell_fs()
o Made PM_BASE request/reply number range unique
o Hacked in a horrible temporary workaround into RS to deal with newly
  revealed RS-PM-VFS race condition triangle until VFS is asynchronous

System signal handling:
o Fixed shutdown logic of device drivers; removed old SIGKSTOP signal
o Removed is-superuser check from PM's do_procstat() (aka getsigset())
o Added sigset macros to allow system processes to deal with the full
  signal set, rather than just the POSIX subset

Miscellaneous PM fixes:
o Split do_getset into do_get and do_set, merging common code and making
  structure clearer
o Fixed setpriority() being able to put to sleep processes using an
  invalid parameter, or revive zombie processes
o Made find_proc() global; removed obsolete proc_from_pid()
o Cleanup here and there

Also included:
o Fixed false-positive boot order kernel warning
o Removed last traces of old NOTIFY_FROM code

THINGS OF POSSIBLE INTEREST

o It should now be possible to run PM at any priority, even lower than
  user processes
o No assumptions are made about communication speed between PM and VFS,
  although communication must be FIFO
o A debugger will now receive incoming debuggee signals at kill time
  only; the process may not yet be fully stopped
o A first step has been made towards making the SYSTEM task preemptible

throw out exec debugging message.

there is no elvis.

audio package obsolete

throw out FIXME reminders for release

Mostly a revert of r5306. com.h defines MAX_NR_TASKS value which replaces
NR_TASKS in the endpoint macros. MAX_NR_TASKS defines the maximal number of
kernel tasks. It is unlikely that we will ever need this many tasks as the goal
is not to have such a difference in the future. For now it makes possible to
remove the limiting NR_TASKS from the endpoint code.

Removed macros that depend on NOTIFY_FROM from servers and drivers. They
determine the information defined by these macros from the m_source field of the
notify message.

add SDL-1.2.13

sort; throw out old packages; qemu in

Removed debug string

revert mkfs change; might run out of inodes, but large number of inodes
makes mkfs not want to mkfs large filesystems.

find optimal formula (e.g. dynamic capping of no. of inodes) later.

disable address space randomisation feature in normal mode.

Macros in endpoint.h need to know about endpoint_t

disable 'clever' optimisation (workaround for vmware(?) problem)

assert overammbitious.

threw out sanity checks before pagetable rewrites, triggering false
page table inconsistencies.

fix handle_memory logic. again.

field for sanity check feature.

new prototypes.

verbose printing and sanity checking functions.

re-enable munmap().

unnecessarily verbose message.

old reminder

get_randomness restored.