Port NetBSD libc functions to Minix.

This patch contains changes to NetBSD libc code base to make it
compile and work on Minix. Some of them are due to actual NetBSD
libc bugs, as we're compiling it in non-reentrant mode and with
a.out support, something not exactly frequent in NetBSD.
Others are proper fixes to port it to Minix (mostly sa_len
parameter missing in socket and a few mmap from files).

This patch modifies the NetBSD basic includes to be Minix
compatible. There are also changes in the make file, mostly to
let them install in /usr/netbsd/include.

Import unmodified NetBSD libc in trunk

This patch imports the unmodified current version of NetBSD libc.
The NetBSD includes are in /nbsd_include, while the libc code itself is
split between lib/nbsd_libc and common/lib/libc.

Unbreak build by fixing typo.

Sorry.

 Use __NBSD_LIBC to specialize common headers for NetBSD headers compilation.

This patch contains the required changes (under __NBSD_LIBC definition) of the common headers to compile the NetBSD libc.

Move network includes and lib.h into common/include subdir.

This patch moves further includes (the network part and lib.h) in common/.
It is the last part to get the netbsd libc to compile under minix. Further moves will be needed as we get the netbsd libc to compile minix itself.

Also, this patch add #ifndef's to termios.h, as it create problems with netbsd's namespace.h.

vm: only suspend and resume process with vmctls in pt_writemap in smp mode

usr/Makefile: added missing sh minibootstrap.sh

memory driver: munmap() imgrd after first close.

(that munmap() range not supported yet by vm.)

take pkgsrc.conf out of the base system.

  . use bmake for pkgsrc instead, reads mk.conf from /usr/pkg/etc/mk.conf
  . tracking bmake from pkgsrc eases tracking pkgsrc
  . further disentangles pkgsrc from base system, reducing maintenance
    burden of pkgsrc

minor release.sh fixes and tweaks

- pre-install bmake for further (future) base/pkgsrc disentanglement
- print url properly for pre-install source
- correct <minix/sys_config.h> source location

top - able to account kernel cpu time to process

procfs - export extra kernel time accounting fields

kernel - account for kernel cpu time (ipc, kcalls) in caller

kernel - change print*() functions for ipc to generic ipc hook functions.

  - used to implement ipc stats tracking code

Move shared headers in common/include

Headers that will be shared between old includes and NetBSD-like includes
are moved into common/include tree. They are still copied in /usr/include
in 'make includes', so compilation and programs aren't be affected.

include - throw out gettiminglocks stuff from include

kernel - doesn't do lock timings any more

is - no more getlocktimings.

Fix comment mutilated by find/replace

/usr/Makefile - automatically update pkgin database too.

/usr/Makefile - automatically install git

some extra math functions from netbsd for netpbm.

always define PKG_TOOLS_BIN

<ansi.h> -> <minix/ansi.h>

<ansi.h> -> <minix/ansi.h>

take pkg_install out of the base system and pre-install it using the
pkgsrc binary packages.

rationale:
  . pkg_install (which is the pkg_* tools) is entangled with pkgsrc,
    not with minix, so tracking it from pkgsrc (easier than with
    base system) makes more sense
  . simplifies upstreaming minix specific changes for pkg_* tools
  . reduce pkgsrc-in-basesystem maintenance burden

update package names in packages.install to new pkgsrc versions

Remove code for kernel task stack initialization

We no longer have kernel tasks, so this code is unnecessary

add minix3.org pkgsrc mirror as backup source

added uint typedef declaration in <minix/types.h>

  . needed for xmlrpc (needed for cmake (needed for compiler-rt))

added <complex.h> (needed for compiler-rt)

Kernel: fix clearing IPC references resulting in system crash

Servers request TSC freq from kernel rather than each one measuring it individually

RS: don't share executable images with a dead process

RS: move setuid() hack to where it belongs.. again.

DS: fix regression in ds_subscribe regex construction

DS: update subscriptions for deleted keys upon process exit

Kernel: fix notification delivery to non-ANY receivers

remove fsck1 altogether

change bitchunk_t from 16-bit to 32-bit

sys/queue.h: add LIST_FOREACH_SAFE

Fix multiboot for ACK-built images

Move the profiling buffer to the end of the data segment

Kernel: statistical profiling fixes

- create name entries for forked processes as well;
- create name entries only for system processes.

vfs - use a static buffer instead of malloc()+free(), solving
recently appeared ENOMEM problems during exec().

Workaround for circular dependency problem in pkgadd

libc and csu updates for ELF

csu/build support for ELF

mkfifo.c: fix ack warning

unstack: ELF support

file(1): Add ELF support

Fix libname in bsd.prog.mk

VFS/RS support for ELF

RS: fix IPC privilege computation bug

Take into account the ALL and ALL_SYS cases when constructing proper
symmetrical IPC send masks. Fix system.conf accordingly, to keep
userland processes from sending to several non-interface servers and
drivers. Also fix IS's F4 formatting.

system.conf: base ipc permissions on process names rather than labels

From now on, the "ipc" directive in system.conf refers to process names
instead of labels, similar to the "control" directive. The old, more
fine-grained approach is deemed unnecessary and cumbersome at this time.

As side effects, this patch unbreaks late IPC permission computation as
well as the filter driver.

Kernel/RS: fix permission computation with 32+ system processes

RS: do not restart file systems

vfs: terminate string in rdlink_direct

Fixes test56 when compiled with GCC.

Fix missing parenthesis (suggested by Antoine Leca)

mkboot: include git id in image name if available.

removed unneeded global var

don't send FS_READY anymore

Fix for objdir feature of BSD make

contributed by Antoine Leca.

decouple file system server start/termination from mount/umount

pkgsrc: Update git repo info

Add machine/param.h

For GCC/clang, don't build in ACK int64 routines

Allow for overriding GCC var in test Makefile

kernel: Use LIBDIR var in Makefile

Instead of using a hard-coded path, use the LIBDIR variable so
the library path can be overridden.

Inlining 64bit integer handling functions

- if gcc/clang is used the C functions that use long long can be
  inlined to get better performance (yes, it makes difference)

kernel/debug.c includes u64.h (fix)

libdriver without mandatory driver main loop

Added possibility to inject input events to tty

M    include/Makefile
A    include/minix/input.h
M    include/minix/com.h
M    drivers/tty/keyboard.c
M    drivers/tty/tty.c
M    drivers/tty/tty.h
M    include/minix/syslib.h
M    lib/libsys/Makefile
A    lib/libsys/input.c

revert r8783, as those entries are auto-generated now

. auto-generate per-directory .gitignore files based on $(CLEANFILES)
. gitignore .gitignore files except for the root one.

Updated some CLEANFILES macros in Makefiles.

Update gitignore

Remove redundant sha2 code from inet

GCC/clang: int64 routines in C

Remove global variable 'i'

update for releases with git.

Use int64 functions consistently

Instead of manipulating the u64_t type directly, use the
ex64hi()/ex64lo()/make64() functions.

Import mkfifo(1) from NetBSD

Import mktemp(1) from NetBSD

Move minix/paths.h to paths.h

Also, merge in relevant macros from NetBSD

.gitignore: also ignore CVS and .svn dirs

   - to make importing from cvs and svn repos smoother

Remove revision IDs from files

add top-level .gitignore.

stdio: split vsprintf and vsnprintf

  - workaround for linking problems

stdio/freopen.c: fill __iotab table with stream pointer

  - lets fclose()d and then freopen()ed streams be fclose()d again
    without error

stdio/fclose.c: reset _buf

  - if the stream gets freopen()ed, avoid buffer being seen as valid

kernel: limit stacktrace depth to 50.

  - Unlikely to discard useful information and avoids long
    system lockups on machines configured to print system output to serial.

/proc/cpuinfo

- when /proc/cpuinfo is read procfs retrievs information about cpus
  from the kernel, formats it and prints it

sys_getcpuinfo()

Kernel keeps information about each cpu

- kernel maintains a cpu_info array which contains various
  information about each cpu as filled when each cpu boots

- the information contains idetification, features etc.

SMP - reduced TLB flushing

- flush TLB of processes only if the page tables has been changed and
  the page tables of this process are already loaded on this cpu which
  means that there might be stale entries in TLB. Until now SMP was
  always flushing TLB to make sure everything is consistent.

Fixed unixbench Run script

- perl path has changed

if verbore=1 tell us who registers which irq handler

- a useful piece of information when debugging

ACPI pci-to-pci bridges

- every pci device which implements _PRT acpi method is considered to
  be a pci-to-pci bridge

- acpi driver constructs a hierarchy of pci-to-pci bridges

- when pci driver identifies a pci-to-pci bridge it tells acpi driver
  what is the primary and the secondary bus for this device

- when pci requests IRQ routing information from acpi, it passes the
  bus number too to be able to identify the device accurately

Zero no more hardwired as BSP apic id

- the BSP apic id is written in the io apic redirection entries to
  deliver the interrupts to BSP